Ils paradent, volent en festons (vol en cloche et en loopings de parade et pour marquer le territoire) construisent leur nid ou en réhabilitent un ancien avec des branches neuves.
L’aigle royal est une espèce monogame. Le mâle et la femelle sont unis pour la vie, fidèles à leur territoire. Ils construisent plusieurs nids (aires) qu'ils utilisent pendant plusieurs années, souvent ils peuvent en privilégier un. La couvaison et l’élevage s’étendent de mars à août. Il peut y avoir 1 à 2 jeunes par nid. Il arrive qu’un des jeunes soit éliminé par le premier éclos. On parle alors de "caïnisme".
La nidification n’est pas toujours couronnée de succès et plusieurs années peuvent se passer avant qu’un seul aiglon ne s’envole, après être resté au nid de mars à juillet.
Les gardes-moniteurs sont à l'affut pour trouver l'aire qui sera choisie cette année afin de suivre la reproduction des couples jusqu'à l'envol de leur poussin.